كان لروبرت إي لي، رئيس ما كان يعرف آنذاك بكلية واشنطن (الآن جامعة واشنطن ولي) في ليكسينغتون، دور فعال في بناء كنيسة المدرسة في 1867. على الرغم من أن تصميم المبنى البسيط المصمم على الطراز النورماندي الجديد قد نُسب منذ فترة طويلة إلى لي، إلا أن الوثائق أثبتت أن المبنى من عمل الكولونيل توماس هومز ويليامسون، أستاذ الهندسة المدنية والعسكرية في معهد فيرجينيا العسكري. ومع ذلك، يبدو أن ويليامسون عمل عن كثب مع لي في صياغة التصميم. سُجِّي جثمان القائد الكونفدرالي السابق في الكنيسة في 1869 ودُفن فيما بعد في سرداب عائلي أقيم هناك. في عام 1883 تم الانتهاء من ملحق خلفي صممه ج. كروفورد نيلسون لإيواء تمثال لي الراقد للنحات إدوارد فالنتين من فيرجينيا. تم الحفاظ على مكتب لي في الطابق السفلي للكنيسة بعناية كما تركه. وفي 2021 قرر مجلس الأمناء في إعادة تسمية المبنى بمبنى مصلى الجامعة & غاليري.